V souvislosti se snahami o vybudování české vysoké školy v Brně,  zřídil český vlastenec Václav Robert Kounic (Kaunic) nadaci pro výstavbu studentských kolejí. Stavět se začalo  v roce 1922 a vlastní koleje byly otevřeny v listopadu 1923. Po okupaci v roce 1939 začaly být Kounicovy koleje využívány jako věznice, kterou během války prošlo několik desítek tisíc odbojářů i nevinných lidí. Popravovalo se na nádvoří zastřelením nebo oběšením, popravy byly veřejné. Aktuálně budova slouží stále k ubytování studentů. Od roku 1978 jsou koleje národní kulturní památkou.